胃肠肿瘤中心三病区是以消化道肿瘤为主要病种，特别是对结直肠肿瘤的，科室长期以来，坚持以“病人为中心”，消化道肿瘤，特别是综合方面积累了丰富的经验。科室主任顾晋教授现任中华肿瘤学会全国副主任委员，中国协会大肠癌专业委员会副主任委员，并为美国外科学院外籍会员（FACS）。在结直肠癌的方面积累了丰富的经验，科室坚持多学科联合查房，每周进行包括肿瘤影像，肿瘤内科及放疗科，病理科等多学科会诊，坚持为病人带来符合国际规范的综合。对胃癌的综合规范化也具有相当的经验。科室现有主任医师3名，副主任医师3名，主治医师3名，住院医师2名，高年医师均具有留学经历，大多具有博士、硕士学位。科室承担国家及省部级多项科研项目，每年在国际知名杂志上发表多篇专业论文。胃肠外二科注重瞄准国际消化外科发展前沿，与世界多个知名的结直肠外科中心建立联系，包括美国，法国，英国等多个国家的知名专家均曾多次莅临我科进行学术交流，胃肠外二科近年来所取得的成绩也得到国际同行的认可。
北京大学肿瘤医院肝胆胰外一科创建于1996年。现有病床33张，医师10人，其中正高职称医生2人，副高职称1人，中级职称4人，在读研究生4人，所有医生均为研究生毕业。建科以来，在黄信孚及邢宝才主任的领导下，科室全体医师秉承以"延长病人生存，改善病人生活质量，为病人解除病痛"为目标，把肝胆胰肿瘤综合的理念与肝胆胰外科手术的近技术相结合，不断创新，不断提高，不断完善，形成了鲜明的本科室的诊疗特色。在医疗、科研和教学方面居国内水平。同时，培养出了一大批研究生和青年医师。
现任主任邢宝才，教授，主任医师。担任：中国协会肝癌专业委员会常委，中华外科学会肝脏外科学组委员，中华肿瘤学会肝癌学组委员，中国协会大肠癌肝转移学组委员，中国协会胆道肿瘤委员会常委，中国协会胰腺癌委员会委员，卫生部肿瘤规范化专家委员会委员，北京协会理事，北京协会肝胆胰肿瘤委员会主任委员，北京肿瘤学会委员，北京大学肝癌中心副主任，北方肝癌专家委员会副主任。同时担任多种杂志的编委和审稿专家。
肿瘤妇科现有床位32张，医护人员20人，其中副主任医师以上医师3人，承担着医疗、教学和科研工作。
主要诊治妇科各种良、恶性肿瘤，包括卵巢、子宫体、宫颈、阴道和外阴的良恶性肿瘤等。开展全子宫切术、附件切除术、子宫广泛性切除及次广泛切除术、卵巢癌减瘤术、阴式子宫切除术、宫腔镜、腹腔镜手术及LEEP刀宫颈锥切术。以妇科肿瘤的综合为特色，强调个体化综合方案，擅长难治性或复发妇科恶性肿瘤的。主要特色包括：
1. 擅长难治性或复发妇科恶性肿瘤的。依据患者病情，合理地应用手术、化疗、放疗、介入和生物等手段，制定个体化方案，延长患者的生存期，提高患者的生活质量。
2. 顺应微创外科的潮流，积极开展微创手术，包括腹腔镜下广泛子宫切除、盆腔淋巴结清扫术、宫腔镜下肿瘤切除术、宫颈LEEP刀锥切术、子宫内膜热球、阴式子宫切除术等。在保证效果的同时，减轻患者的痛苦，缩短术后恢复时间。
3. 与肿瘤内、外科专业组密切合作，对消化道恶性肿瘤的卵巢转移以及乳腺癌内分泌后的妇科问题采取有力的措施进行，取得了一定的效果。
肿瘤妇科的全体医护人员继承老一代艰苦创业、科学求实的学风，坚持以病人为中心，规范医疗行为，保障医疗，降低医疗费用，提高医疗质量，以高水平的医疗技术和体贴周到的服务，让患者得到满意的效果。
乳腺肿瘤内科是以进展期乳腺癌诊治为主的专科临床科室，现有主任医师3名，副主任医师1名，主治医师5名，住院医师2名，临床护士20名，开放床位33张。科室以乳腺癌综合为重点，包括化疗、内分泌、靶向等，强调规范化基础上的个体化，尤其对于复发转移性乳腺癌的更有丰富的经验和独到的见解，诊治水平在国内享有盛誉，是NCCN乳腺癌指南中国版内科部分执笔人之一，主持和参与多项国内外临床试验。乳腺肿瘤内科近5年主持或参与完成了多项国家自然科学基金、国家973项目分课题、北京市新世纪百千万人才工程、首都医学发展科研基金、教育部高等学校博士学科点专项科研基金、北京市卫生系统高层次人才培养计划、国家“十二五”重大专项课题。发表文章百余篇，其中SCI文章三十余篇。